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颌面外科：口腔CT技术的比较大的特点是以立体形态的方式显示口腔颌面部复杂区域的解剖结构。帮助术前了解智齿和神经管的关系；术前了解颌骨肿瘤的大小、边界及其对周围组织的影响；术前了解多生牙的方向及其邻近组织关系等，提高手术安全性。术前了解颌骨外伤骨折线走向及错位情况。
牙体牙髓：由于口腔牙齿的排列不在一个平面上，且具有一定的生理弧度，普通X线往往使图像相互重叠，口腔CT的三维成像对牙体、牙周膜等微细结构显示更加清晰。可以帮助医生了解断根，评估牙根内吸收情况及根管钙化等，能用于根管治疗前寻找根管，术后评估根管充填情况等。
正畸治疗：众所周知，正畸治疗前对牙列的判断是影响治疗方案和末了效果的关键因因素。口腔CT让我们在制订治疗方案前能清楚地评估牙根的方向及其与邻牙的关系，大大地提高了治疗方案的准确性，也避免了正畸不当导致牙根损伤的风险。
种植牙：利用口腔CT准确判断全口牙床的位置、牙槽骨的高度和深度等，医生可在计算机上清楚判读出牙槽骨的情况，重建成3D数字模型，在计算机上事前做好种植计划，选择适当的种植体，决定种植位置与角度，进而制造成准确的手术模板，让种植牙更加安全。